本书根据《施工合同司法解释（二）》的条文内容将全书分为五章，分别为：【第一章】合同效力及相关问题；【第二章】工期、质量及价款结算；【第三章】　工程司法鉴定；【第四章】建设工程价款优先受偿权；【第五章】实际施工人权利保护。

每一章都设置了【本章要旨】【办案思路】和【举证指南】三个栏目，概括的介绍本章的主要内容，案件办理的大致思路和举证的大概方向。

之后，按照《施工合同司法解释（二）》的条文顺序逐条进行分析解读，设置【典型案例（含焦点评析）】【实务争点】【案例索引】【规范链接】四个栏目。

【典型案例（含焦点评析）】结合典型案例对条文内容进行解读；

【实务争点】主要针对条文中未明确但实践中仍然存在广泛争议的问题展开论述，为本书的亮点；

【案例索引】为与本条内容相关联的案例，方便读者延伸学习；

【规范链接】为与本条内容相关联的各地法院指导性意见，方便读者了解该问题在司法实践中的全貌。