《中国义务教育发展报告2013》继续采取以调查研究为主，文献研究、比较研究、统计分析等为辅的研究方法。该报告通过文献研究，梳理了2012年中国义务教育发展的成就、特点和问题，点击了2012年中国义务教育发展中的教育经费投入、教育督导、教辅新政等十件大事。报告还通过简析2008年到2012年五年内《中国义务教育统计年鉴》上的有关数据，研究我国义务教育发展的基本走势，客观地呈现我国义务教育发展的东部、东北部、中部、西部四个区域差异。该报告还通过比较研究，分析美国、英国、日本、新加坡等发达国家以及印度、泰国等发展中国家，实施义务教育的成功经验和有关政策支持，为我国义务教育改革与发展提供参考和借鉴。该报告在附件中围绕2012年的调研专题梳理了我国义务教育有关政策、法规。针对2012年我国义务教育发展的热点、难点问题，我们在有关文献研究基础上又征求数百位行政领导、专家学者以及一线教师代表的意见，并与他们共同探讨，最终选择了课业负担、标准化学校建设、教辅使用、学生体质等七个专题进行深度调研。调研范围涉足我国20多个省（市、区），涉及东部、东北部、中部、西部四大区域中部分有代表性的市、区县教育行政部门、学校等，深入中小学课堂，采取问卷调查、半结构化访谈法、焦点小组访谈法等，反映了2012年我国义务教育的真实“生态”和实际诉求。
　　《中国义务教育发展报告2013》围绕2012年中国义务教育的发展，其主要内容分发展概况、专题报告、区域报告、国际经验四大部分。该报告还有附录，包括义务教育政策法规、中国义务教育发展报告课题组调研咨询过程两部分。