《明代政治制度的源流与得失》：

本书凝结了历史学家朱永嘉先生有关明史研究的心得。作者以明代政治制度为中心，上溯渊源，下析演化，从国家管理的组织结构及其运行机制上剖析中国政治制度演化中的核心问题，举 凡内宫、外朝、军兵、司法，从决策到行政、从中央到地方等方方面面的相互关系，都作了全面深入的阐述。作者还对众说纷纭的分封制与郡县制问题、军兵问题、制度设计问题进行了探讨与厘清，并对东宫制度做了开创性的梳理工作。

《论李贽》：

　　千古是非谁定论，焚书藏书见真章，独树一帜，敢为异论，中国思想史上罕见的叛逆者，其著作一再被禁毁，却流传至今，读中晚明历史，绕不过一个李贽。
　　毛晚年亲自辑录李贽《史纲评要》23条，旨趣深远；复旦大学历史系老教授朱永嘉结合史事详尽解读，阐幽发微。
　　凡事要坚持道义或者真理，那就应敢于藐视高高在上的大人物之一切错误的言论，没有这个勇气，那就不可能成为一个有道义的人。
　　
《商鞅变法与王莽改制》：
　　《商鞅变法与王莽改制》通过分析中国历史上的两次著名改革——商鞅变法与王莽改制，来探讨何谓真正的进步的改革、如何改革才能符合历史潮流以及改革者的素质与命运等同题。
　　《商鞅变法与王莽改制》作者结合时代环境和历史现状，着重从解读改革的思想资源入手，分别讲述了两次改革的具体措施和实际进程，并借此说明：一场改革的开展需要法、势、术三者结合，两改革成败的关键在于是否从实际存在的社会矛盾和问题出发，调节各个群体间的利益关系，让多数人受益。
　　
《刘邦与项羽》：
　　《刘邦与项羽》是一部解读楚汉风云人物的论史著作，以风云四起的秦末为背景，根据《史记》《汉书》等史书，鸠集传记，增广时闻，有评有述，详细解析刘邦、项羽及相关人物，全面破译了楚汉争霸过程中二人一成一败的个人因素和历史根由，揭示了历史演进与个人命运的联系。
　　《刘邦与项羽》作者以其独特的人生经历和深厚的学术修养，秉持以史为鉴、古为今用的史学宗旨，知人论世，从而得出富有教益的观点。
　　
《论曹操》：
　　曹操历来是个颇有争议的人物，关于他的描述，魏人与吴人大不一样，同样一件事，如赤壁之战，魏、蜀、吴三方的记载也差异甚大。

　　《论曹操》以《三国志·魏书·武帝纪》为主线，鸠集各种史料，从大众读史的视角，梳理其生平事迹，并围绕东汉末年的社会情形与局势，详细解读三国时期曹操及相关人物和事件，在种种矛盾的陈述中，作出合理的推断。
　　《论曹操》作者设身处地，沟通古今，思考深远，饱含历史经验和思想、政治智慧。
　　
《从万历到康熙》：
　　从明代后期财政问题及社会演变讲起，叙述明朝灭亡与清朝建立的经过，以及清初巩固统治、加强对边疆地区控制的具体情况，重点在于总结明亡清兴的历史经验教训。清朝统治的完全巩固是由康熙帝完成的，可以说康熙时期也是清朝非常强盛的时期，到雍正，乾隆时期已经逐渐走下坡路了。从明朝的万历到清朝的康熙，恰恰是中国古代历史上王朝兴衰周期率的一个典型案例，这也是《从万历到康熙》命名之由来。