本书是本书是继《唯实主义》之后 “董学与孔学辨正系列”丛书的第二部，是董学与孔学唯实比较的著作，主题是对董学（董仲舒的哲学体系）和孔学（孔子思想）进行唯实比较，以探索这个持续了两千多年的哲学和历史迷案，解开一些学术和历史谜团。为此，本书以两者的观念事实为基础，通过对董学和孔学的唯实比较，进行拨乱反正和正本清源的工作，为重新阐明中国传统哲学的核心、主题和逻辑主线，为构建符合观念事实和历史事实的中国哲学史做出一些有益的探索和尝试。

传统的观念认为中国传统文化是儒家思想，儒家思想是中国传统哲学史当然的核心和逻辑主线，作为儒家思想的创始人和代表人物的孔子是中国传统哲学史最核心的人物，是中国文化的基石，是中国传统文明的奠基人。这个观点似乎是关于中国文化和中国传统哲学史的常识性结论。而本书则提出质疑，认为中国传统哲学的奠基人是董仲舒，董学才是中国传统文明的真正基石，董仲舒与汉武帝根据董学创立了新的国家意识形态，并且在此基础上构建了“公羊模式”，革命性地改变了中国历史的进程，也使中国文明发生了质变。也就是说，董仲舒才是中国传统文明的奠基人，董学才是中国哲学和中国传统文明的主题和主旋律。

为此，书中对董学和孔学进行了系统、全面、深入、公正的比较。根据内在的逻辑线索和内容，分为五部。

第一部是董学的本质。集中分析了董学的体系，涉及核心概念体系、方法论、天人合一理论、阴阳哲学、人性理论、皇权主义的政治哲学、教化论以及在国家体制方面的设计和政策建议等诸方面，挖掘其价值观。

第二部是孔学的本质。集中分析了孔子的思想，涉及核心概念体系、理念、方法论，指出孔学内部诸多空白领域和内在悖论，对其价值观进行认定。

第三部是对比董学与孔学是完全不同的哲学思想。对董学和孔学的本质进行了概括性的总结，指出两者是本质上完全不同的哲学思想，体现相互对立的价值观。两者另一个重要的分野在于董学是皇权时期的国家意识形态，而孔学是这个意识形态的组成部分，是由皇权树立起来的“形象代言人”。

第四部是董学与孔学的重新定位。对董学与孔学的真正关系进行了重新定位，认为董学是中国传统文明的国家意识形态，孔学只是这个意识形态的一个局部，中国哲学史的主线是董学而不是孔学。董学对孔学进行了扬弃和同化，成为其体系中的一个子系统和一项具体的政策。

第五部是董仲舒的“托孔入世”的策略考辨。对董仲舒对于孔学的处理方式即“托孔入世”的策略进行了系统的考辨，认为这是中国哲学史“董冠孔戴”现象的滥觞。