《清水祖师文化研究》为刘家军博士和厦大几位教授带领厦门大学人文学院近二十位博士、硕士和本科生在安溪蓬莱镇所做的人类学田野调查报告结集，在掌握了第一手资料的基础上，围绕安溪清水祖师文化撰写了60多篇田野报告和研究文章，并举行两岸清水祖师文化学术研讨会。主要分成四个部分：一是清水祖师文化的专题研究，阐述近年来清水祖师文化研究动态以及信俗伦理精神、传说故事价值和与儒释道的关系。二是清水祖师信俗文化的海内外延播和庙宇建筑艺术分析。三是安溪清水岩风景区和清水祖师文化旅游的开发建设和应用人类学分析。四是安溪清水岩风景区和清水祖师文化采风札记和田野考察印象，题材多样，散文杂记并重。全书着重围绕安溪清水岩旅游风景区开发和闽台清水祖师民间信俗文化的流播展开调研和探讨，作为文化人类学的研究个案，不涉及宗教信仰问题。