分子动力学模拟是近年来飞速发展的一种分子模拟方法，它以经典力学、量子力学、统计力学为基础，通过计算机数值求解分子体系运动方程的方法，模拟研究分子体系的性质。目前，分子模拟已经成为继实验和理论研究方法之后，研究分子体系性质的第三种研究方法，被广泛用于化学、化工、生物、医药、材料科学、物理等领域。全书容分为三个部分：㈠介绍分子的物理模型，分子间相互作用，以及常用的分子力场。㈡介绍分子动力学模拟的基本原理与方法，包括分子体系运动方程的数值解方法、分子动力学模拟方法的理论基础等。㈢介绍常用的分子动力学模拟算法和技巧，模拟结果的分析与讨论。考虑到与分子动力学模拟有关的文献中理论框架、术语、符号等的不统一给读者带来的不便，《分子动力学模拟的理论与实践》将以分子的物理模型、分子动力学模拟的理论基础、模拟结果的分析与讨论这样的框架介绍分子动力学模拟。同时，《分子动力学模拟的理论与实践》将努力建立一套统一的术语和符号，以期给读者最大的方便。