本书聚焦研究目标，根据研究内容，在综述现有研究成果的基础上，利用中国统计年鉴、中国科技统计年鉴、全国企业创新调查年鉴的宏观统计数据和从万得资讯（Wind资讯）、国泰安（CSMAR）数据库筛选出的2014—2016 年连续3年被认定为高新技术并享受15%优惠税率的744家企业相关财务指标和研究开发微观数据。采用文献研究、比较分析、归纳演绎等定性研究方法，梳理税收优惠政策促进企业自主创新的理论依据，并对促进企业自主创新的税收优惠政策进行理论模型推导，深入分析我国企业自主创新现状及相关税收优惠政策，总结促进企业自主创新税收优惠政策存在的问题，梳理世界部分国家促进企业自主创新的税收优惠政策典型经验做法等。
同时采用横截面个体加权广义最小二乘法 ，描述性统计中的频数分析及方差分析等定量研究方法分析我国企业自主创新的总体状况，尤其是对税收优惠政策促进企业自主创新的总体效应，税收优惠政策与财政补贴政策促进企业自主创新效应的比较，税率型税收优惠政策与税基型税收优惠政策促进企业自主创新的效应比较，不同类型税收优惠政策促进企业自主创新效应分企业所处行业、企业所处地区、企业所有制性质、企业的成长阶段进行异质性实证计量模型检验。
最后基于研究结论，并结合我国当前推进供给侧结构性改革，促进经济高质量发展，将科技自立自强作为国家发展的战略支撑，不断完善国家创新体系，加快建设科技强国等具体情况，在加快制定坚持有利于实现财政法治化原则，税收效率原则，税收公平原则等促进企业自主创新税收优惠政策基本原则的基础上，提升企业自主创新税收优惠政策权威，明确企业自主创新税收优惠政策重点，规划企业自主创新税收优惠政策内容，完善企业自主创新税收优惠政策方式，加强企业自主创新税收优惠政策管理等方面优化促进企业自主创新的税收优惠政策体系。同时从完善科技投入政策，完善金融支持政策，完善政府采购支持政策，完善人才培养支持政策，完善知识产权保护政策等方面完善促进企业自主创新的相关配套政策。