《历代医家方论十大名著：医方考》收集明代前临床常用方剂671首（除去重复，实568首），《医方考》按疾病分72门，每门之下列医方若干。在各门医方之前皆先以概说其病因、病机，然后汇类方于门下，逐方列出方药及主治，后再予方论，每方论说，吴氏均“考其方药，考其见证，考其名义，考其事迹，考其变通，考其得失，考其所以然之故，非徒苟然志方而已”（《医方考·序》），也就是说，并对每一首医方阐明其方名、组方结构、药物效能、方义功能、适应症、辨证加减、副作用及禁忌症等理论分析，其理论分析上溯《内经》《伤寒论》，下逮金元四大家之著，及诸其他如《千金方》《普济本事方》等，此外尚有吴氏的临床经验和心得，使学者知其所以然，融会贯通，应用时得心应手。