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「真相就像骨頭，雖然隱藏在皮膚、脂肪與血肉之下，卻默默支撐著所有的一切。
事物之間必有關連，就像生物必有骨肉一樣。」

擔任法醫學教授的叔叔說過的這一段話，在年幼的九條櫻子心中悄然萌芽。
北海道旭川市有棟古老洋房，裡面住著妖怪婆婆，和一位酷愛屍體的深閨大小姐──九條櫻子。櫻子小姐外表看來是個脫俗的大美人，骨子裡卻是個熱中解剖的屍體愛好者，不但在自家院子裡埋了兩隻海豚、一隻小鯨魚、一隻棕熊、三頭鹿和三匹馬的屍體，而且數量仍在持續增加。

家住附近的平凡高中生館脇正太郎，在偶然間認識了櫻子小姐，明知她性情古怪、缺乏同理心、說話不經大腦，卻又為她偶來的微笑與赤子之心所著迷，跟著她哪兒有屍體就往哪兒跑，為了解謎忙得暈頭轉向！

這天，正太郎的媽媽經營的出租公寓有房客失聯，媽媽找他去幫忙查看，怎知房門一開，櫻子小姐便心花怒放──眼前是一具發出腐臭的屍體。凡事看重事物本質的她，將憑藉著法醫學的豐富知識，抽絲剝繭地解開密室真相！但是，這個行為卻在無形中傷了正太郎的心？同樣擁有善良之心的兩人，為什麼會背道而馳呢？

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