《哲学原理》是笛卡尔晚年的一部著作，1644年以拉丁文形式出版，后由皮科译为法文。《哲学原理》比较系统地呈现了笛卡尔的哲学体系。《哲学原理》分为四部分，在第一部分，笛卡尔仍让人由怀疑而达于确信，仍让人确信上帝的存在，此外，他还解释了广延和思想的关系，错误的起源，普遍概念的形式，以及实在的、情状的和论理的三种区分。在第二部分，笛卡尔讨论物质事物的本性，虚空之非有，进而提出其物理学说，认为一切现象都是由物质分子的大小、形象和运动之变化生起的。在第三部分，笛卡尔讨论了太阳系的学说，以及一般恒星的本性和起源。他假设了密度不同的三种元素，用循环运动说来解释全部宇宙。在第四部分，笛卡尔讨论了地球的形成，还讨论了水、火，以及各种自然矿物。最后讨论了感官的本性。